Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Actn1Q7TPR4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Actn1Q7TPR4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.4 ms