Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpf1Q7TND5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms