Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcl2Q78Y63 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcl2Q78Y63 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms