Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SynmQ70IV5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SynmQ70IV5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SynmQ70IV5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SynmQ70IV5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SynmQ70IV5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SynmQ70IV5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms