Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms