Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt9Q6RHW0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt9Q6RHW0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms