Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cacna2d2Q6PHS9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms