Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGC9

Zfp341, Zinc finger protein 341, mousemouse

Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp341Q6PGC9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp341Q6PGC9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp341Q6PGC9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp341Q6PGC9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms