Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H6

Frmd5, FERM domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd5Q6P5H6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmd5Q6P5H6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmd5Q6P5H6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmd5Q6P5H6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmd5Q6P5H6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmd5Q6P5H6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmd5Q6P5H6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmd5Q6P5H6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmd5Q6P5H6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmd5Q6P5H6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmd5Q6P5H6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmd5Q6P5H6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmd5Q6P5H6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd5Q6P5H6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd5Q6P5H6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmd5Q6P5H6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmd5Q6P5H6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmd5Q6P5H6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmd5Q6P5H6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmd5Q6P5H6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmd5Q6P5H6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmd5Q6P5H6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmd5Q6P5H6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms