Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sik3Q6P4S6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sik3Q6P4S6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sik3Q6P4S6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms