Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gpbp1l1Q6NZP2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpbp1l1Q6NZP2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms