Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Soga3Q6NZL0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Soga3Q6NZL0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms