Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rad17Q6NXW6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rad17Q6NXW6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rad17Q6NXW6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms