Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Cep170Q6A065 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Cep170Q6A065 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Cep170Q6A065 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cep170Q6A065 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Cep170Q6A065 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cep170Q6A065 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Cep170Q6A065 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Cep170Q6A065 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
Cep170Q6A065 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cep170Q6A065 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cep170Q6A065 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cep170Q6A065 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Cep170Q6A065 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cep170Q6A065 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cep170Q6A065 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Cep170Q6A065 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cep170Q6A065 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cep170Q6A065 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Cep170Q6A065 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
Cep170Q6A065 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cep170Q6A065 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Cep170Q6A065 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cep170Q6A065 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cep170Q6A065 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cep170Q6A065 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Cep170Q6A065 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms