Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdzrn3Q69ZS0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms