Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sbno1Q689Z5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Sbno1Q689Z5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms