Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80dQ66JY2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms