Protein–RNA interactions for Protein: Q640L3

Ccpg1, Cell cycle progression protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccpg1Q640L3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccpg1Q640L3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccpg1Q640L3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccpg1Q640L3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccpg1Q640L3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccpg1Q640L3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccpg1Q640L3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccpg1Q640L3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccpg1Q640L3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccpg1Q640L3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccpg1Q640L3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccpg1Q640L3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccpg1Q640L3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccpg1Q640L3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccpg1Q640L3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccpg1Q640L3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccpg1Q640L3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccpg1Q640L3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccpg1Q640L3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccpg1Q640L3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccpg1Q640L3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccpg1Q640L3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms