Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps72Q62481 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps72Q62481 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms