Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ss18Q62280 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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