Protein–RNA interactions for Protein: Q61923

Kcna6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna6Q61923 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kcna6Q61923 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kcna6Q61923 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kcna6Q61923 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kcna6Q61923 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kcna6Q61923 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kcna6Q61923 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kcna6Q61923 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kcna6Q61923 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kcna6Q61923 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kcna6Q61923 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kcna6Q61923 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kcna6Q61923 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kcna6Q61923 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kcna6Q61923 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kcna6Q61923 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kcna6Q61923 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kcna6Q61923 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms