Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn1Q61809 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn1Q61809 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn1Q61809 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn1Q61809 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn1Q61809 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn1Q61809 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Lrrn1Q61809 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn1Q61809 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn1Q61809 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn1Q61809 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn1Q61809 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn1Q61809 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn1Q61809 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn1Q61809 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Lrrn1Q61809 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrn1Q61809 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrn1Q61809 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrn1Q61809 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Lrrn1Q61809 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrn1Q61809 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrn1Q61809 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrn1Q61809 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Lrrn1Q61809 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrn1Q61809 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrn1Q61809 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrn1Q61809 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Lrrn1Q61809 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrn1Q61809 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrn1Q61809 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrn1Q61809 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrn1Q61809 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Lrrn1Q61809 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrn1Q61809 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Lrrn1Q61809 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrn1Q61809 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrn1Q61809 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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Lrrn1Q61809 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Lrrn1Q61809 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Lrrn1Q61809 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrn1Q61809 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrn1Q61809 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrn1Q61809 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms