Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gli3Q61602 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gli3Q61602 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Gli3Q61602 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gli3Q61602 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gli3Q61602 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gli3Q61602 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gli3Q61602 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Gli3Q61602 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gli3Q61602 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gli3Q61602 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gli3Q61602 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gli3Q61602 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gli3Q61602 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gli3Q61602 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gli3Q61602 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gli3Q61602 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gli3Q61602 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gli3Q61602 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms