Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpc6Q61143 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc6Q61143 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.6 ms