Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ift20Q61025 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ift20Q61025 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ift20Q61025 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.5 ms