Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppp1r1bQ60829 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms