Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SkiQ60698 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SkiQ60698 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SkiQ60698 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SkiQ60698 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SkiQ60698 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SkiQ60698 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SkiQ60698 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SkiQ60698 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SkiQ60698 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SkiQ60698 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms