Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sik1Q60670 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sik1Q60670 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sik1Q60670 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sik1Q60670 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sik1Q60670 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sik1Q60670 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sik1Q60670 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sik1Q60670 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Sik1Q60670 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sik1Q60670 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sik1Q60670 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sik1Q60670 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sik1Q60670 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Sik1Q60670 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Sik1Q60670 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sik1Q60670 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Sik1Q60670 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Sik1Q60670 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sik1Q60670 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Sik1Q60670 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sik1Q60670 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sik1Q60670 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sik1Q60670 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sik1Q60670 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Sik1Q60670 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sik1Q60670 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sik1Q60670 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Sik1Q60670 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Sik1Q60670 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Sik1Q60670 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sik1Q60670 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Sik1Q60670 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Sik1Q60670 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sik1Q60670 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sik1Q60670 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sik1Q60670 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sik1Q60670 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms