Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam46cQ5SSF7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam46cQ5SSF7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms