Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmtc2Q56A06 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmtc2Q56A06 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmtc2Q56A06 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms