Protein–RNA interactions for Protein: Q52KH6

Gm14685, DNA segment, Chr X, Baylor 18, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14685Q52KH6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm14685Q52KH6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms