Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc27a5Q4LDG0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc27a5Q4LDG0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc27a5Q4LDG0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc27a5Q4LDG0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc27a5Q4LDG0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc27a5Q4LDG0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc27a5Q4LDG0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc27a5Q4LDG0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc27a5Q4LDG0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc27a5Q4LDG0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc27a5Q4LDG0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc27a5Q4LDG0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc27a5Q4LDG0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms