Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx49Q4FZF3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx49Q4FZF3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms