Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms