Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms