Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trat1Q3UU67 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trat1Q3UU67 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trat1Q3UU67 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms