Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fchsd2Q3USJ8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fchsd2Q3USJ8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms