Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SfswapQ3USH5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SfswapQ3USH5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms