Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp30Q3UN04 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp30Q3UN04 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp30Q3UN04 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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