Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Washc4Q3UMB9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Washc4Q3UMB9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms