Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnft2Q3UF64 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnft2Q3UF64 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms