Protein–RNA interactions for Protein: Q3U552

A930003A15Rik, RIKEN cDNA A930003A15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930003A15RikQ3U552 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A930003A15RikQ3U552 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930003A15RikQ3U552 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms