Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vars2Q3U2A8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vars2Q3U2A8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vars2Q3U2A8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 369.6 ms