Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYD6

Lmtk2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, mousemouse

Predictions only

Length 1,471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk2Q3TYD6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lmtk2Q3TYD6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lmtk2Q3TYD6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lmtk2Q3TYD6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lmtk2Q3TYD6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Lmtk2Q3TYD6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lmtk2Q3TYD6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lmtk2Q3TYD6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lmtk2Q3TYD6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lmtk2Q3TYD6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lmtk2Q3TYD6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lmtk2Q3TYD6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lmtk2Q3TYD6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lmtk2Q3TYD6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lmtk2Q3TYD6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lmtk2Q3TYD6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lmtk2Q3TYD6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Lmtk2Q3TYD6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lmtk2Q3TYD6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Lmtk2Q3TYD6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lmtk2Q3TYD6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lmtk2Q3TYD6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lmtk2Q3TYD6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lmtk2Q3TYD6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lmtk2Q3TYD6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lmtk2Q3TYD6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lmtk2Q3TYD6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lmtk2Q3TYD6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Lmtk2Q3TYD6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lmtk2Q3TYD6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lmtk2Q3TYD6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lmtk2Q3TYD6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lmtk2Q3TYD6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lmtk2Q3TYD6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lmtk2Q3TYD6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lmtk2Q3TYD6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lmtk2Q3TYD6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lmtk2Q3TYD6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms