Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sppl2bQ3TD49 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sppl2bQ3TD49 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sppl2bQ3TD49 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms