Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Col24a1Q30D77 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col24a1Q30D77 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col24a1Q30D77 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms