Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Gli2Q0VGT2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Gli2Q0VGT2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Gli2Q0VGT2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Gli2Q0VGT2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Gli2Q0VGT2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gli2Q0VGT2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gli2Q0VGT2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gli2Q0VGT2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gli2Q0VGT2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Gli2Q0VGT2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Gli2Q0VGT2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Gli2Q0VGT2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Gli2Q0VGT2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Gli2Q0VGT2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Gli2Q0VGT2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Gli2Q0VGT2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Gli2Q0VGT2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Gli2Q0VGT2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Gli2Q0VGT2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gli2Q0VGT2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Gli2Q0VGT2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Gli2Q0VGT2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Gli2Q0VGT2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gli2Q0VGT2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gli2Q0VGT2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gli2Q0VGT2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gli2Q0VGT2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gli2Q0VGT2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gli2Q0VGT2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gli2Q0VGT2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gli2Q0VGT2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gli2Q0VGT2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gli2Q0VGT2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gli2Q0VGT2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gli2Q0VGT2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gli2Q0VGT2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gli2Q0VGT2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gli2Q0VGT2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gli2Q0VGT2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gli2Q0VGT2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gli2Q0VGT2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms