Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp2b3Q0VF55 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp2b3Q0VF55 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms