Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBK2

Krt80, Keratin, type II cytoskeletal 80, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt80Q0VBK2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt80Q0VBK2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt80Q0VBK2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt80Q0VBK2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt80Q0VBK2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms