Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Znf541Q0GGX2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Znf541Q0GGX2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Znf541Q0GGX2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms